WinSCP es un cliente FTP y SFTP de software libre para Windows. La particularidad es que puedes conectarte a servidores SFTP por SSH para enviar y recibir archivos de manera segura ya que el protocolo SSH es encriptado.
Primero debes descargar el programa de http://winscp.net/eng/docs/lang:es e instalarlo. Al iniciarlo aparece esta ventana.
Aqui simplemente debes escribir el servidor, usuario, password y protocolo a usar (FTP, SFTP o SCP). Presionas Conectar y entraras al servidor.
Luego aparece el listado de archivos y ya podras enviar y recibirlos.
Tambien puedes editar, eliminar, crear y eliminar carpetas como cualquier otro cliente FTP/SFTP.
Si tienes puTTY instalado puedes abrir una sesion SSH seleccionando la opcion correspondiente en el menu Comandos.
Y si estas en un servidor FTP tambien esta la opcion en el menu Comandos de enviar comandos FTP manualmente.